Skip to main content

Basics of practical RT-qPCR

This video tutorial is to introduce you on how to prepare reagents and run an RT-qPCR reaction.

About This Course

This video tutorial is to equip you for performing Viral RNA Purification. For this workflow, we are using QIAamp Viral RNA from Qiagen. Other providers would have their own workflow, but in general the principle is to isolate the RNA contents of the virus to be read by the PCR macine.

Requirements

This course requires no prerequisite skills or courses to be completed.

Course Staff

Course Staff Image #1

Ms Caroline Mahendra

Course put together by Caroline Mahendra who is a Product Associate at Nalagenetics

Course Staff Image #2

Dr Astrid Irwanto

Chief Scientific Officer at Nalagenetics

Course Staff Image #2

Ms Jacelyn Phua

Product Development Officer at Nalagenetics

Frequently Asked Questions

Kenapa HEX nya ga muncul?

Invalid, harus ulang dari ekstrasi karena kemungkinan sisa ethanol dari Wash proses waktu ekstrasi menjadi penghambat PCR. Tambahkan step angin kan 3mins, sebelum elution Jika invalid, ulangi dari proses ekstrasi menggunakan sisa sampel yang di simpan kulkas 4C

Kenapa Ct FAM dan HEX telat?

Environmental factors - sisa reagent sedikit kalau sedang pakai sisa stok. Bandingkan dengan plot dalam Positif dan Negatif control, jika Ct di controls juga telat berarti hasil masih valid (ini kepentingan control karena bisa berbeda2 setiap hari maka itu control selalu harus di run dengan bersamaan). Jika perbandingan Ct terlalu beda dengan controls, invalid ulangi lagi PCR dengan stok baru. Ingat untuk hanya jentik2 reagent sedikit dan mini-spin agar semua nya turun ke bawah. Simpan di wadah es untuk menjaga integritas reagent

Apakah extraction kit merk lain compatible?

Bisa, asal extraction yield minimum 0.008ng RNA total. Kit lain seperti Purelink, RNeasy, NEB T2010, MagMax Viral RNA extraction telah di coba di lab lain dan penggunaan masih compatible untuk PCR dengan Fortitude Kits

Fortitude bisa di gunakan di platform PCR lain?

Bisa, IFU claim dari Fortitude masih bisa menghasilkan result di Applied Biosystem 7500 dan LightCycler 480. Yang penting channels yang di butuh kan FAM dan HEX. Namun kami tidak menyarankan karena penggunaan BioRadCFX96 paling universal dan open-ended.

What web browser should I use?

The Open edX platform works best with current versions of Chrome, Edge, Firefox, Internet Explorer, or Safari.

See our list of supported browsers for the most up-to-date information.

Enroll